Mlýn patřil řádu Křížovníků sv. Jana v Manětíně, kteří získali zdejší újezd asi v r. 1187 a zřídili v Manětíně svou komendu. Klášter stál v západní části dnešního zámku. Součástí majetku johanitů byl i mlýn, kteří ho provozovali do r. 1420, kdy Zikmund Lucemburský dal celé Manětínsko jako zástavu Hynku Krušinovi ze Švamberka (někde uváděn Bohuslav ze Švamberka)
1459 Bohuslav ze Švamberka prodal mlýn zákupním právem mlynáři Vojkovi za 7,5 kopy grošů, on a jeho, potomci budou ročně odvádět vrchnosti 1 kopu. Vlastník mlýna nesmí zadržovat vodu na válení suken.
V husitských válkách mlýn poškozen.
4. ledna 1464 mlynář Vojek prodal Štěpánův (původ názvu není znám) mlýn mlynáři Petru Němci (národností) za 16 kop grošů dobrých, protože neměl dostatek prostředků na opravy.